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  • Peter Lackner
  • Josef Laimer
  • Markus Wiederstein
2020

A hybrid of two major Blomia tropicalis allergens as an allergy vaccine candidate

da Silva, E. S., Aglas, L., Pinheiro, C. S., de Andrade Belitardo, E. M. M., Silveira, E. F., Huber, S., Torres, R. T., Wallner, M., Briza, P., Lackner, P., Laimer, J., Pacheco, L. G. C., Cruz, Á. A., Alcântara-Neves, N. M. & Ferreira, F., 1 Jul 2020, in : Clinical and Experimental Allergy. 50, 7, S. 835-847 13 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Retinoic acid-loading of the major birch pollen allergen Bet v 1 may improve specific allergen immunotherapy: In silico, in vitro and in vivo data in BALB/c mice

Hufnagl, K., Afify, S. M., Braun, N., Wagner, S., Wallner, M., Hauser, M., Wiederstein, M., Gadermaier, G., Wildner, S., Redegeld, F. A., Blokhuis, B. R., Hofstetter, G., Pali-Schoell, I., Roth-Walter, F., Pacios, L. F. & Jensen-Jarolim, E., 16 Apr 2020, in : Allergy: European Journal of Allergy and Clinical Immunology.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftLetter

Open Access
2019

Binding of vitamin D3 to the major birch pollen allergen Bet v 1 attenuates its allergenic capacity

Hufnagl, K., Kromp, L., Bianchini, R., Wiederstein, M., Redegeld, F., Hofstetter, G., Roth-Walter, F., F.Pacios, L. & Jensen-Jarolim, E., 2019.

Publikation: KonferenzbeitragPoster

Compound heterozygous SZT2 mutations in two siblings with early-onset epilepsy, intellectual disability and macrocephaly

Domingues, F. S., König, E., Schwienbacher, C., Volpato, C. B., Picard, A., Cantaloni, C., Mascalzoni, D., Lackner, P., Heimbach, A., Hoffmann, P., Stanzial, F., Hicks, A. A., Parmeggiani, L., Benedicenti, F., Pellegrin, S., Casara, G. & Pramstaller, P. P., Mär 2019, in : Seizure : the journal of the British Epilepsy Association. 66, S. 81-85 5 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Open Access

Rational Design, Structure-Activity Relationship, and Immunogenicity of Hypoallergenic Pru p 3 Variants

Eichhorn, S., Hörschläger, A., Steiner, M., Laimer, J., Jensen, B. M., Versteeg, S. A., Pablos, I., Briza, P., Jongejan, L., Rigby, N., Asturias, J. A., Portolés, A., Fernandez-Rivas, M., Papadopoulos, N. G., Mari, A., Poulsen, L. K., Lackner, P., van Ree, R., Ferreira, F. & Gadermaier, G., Sep 2019, in : Molecular Nutrition and Food Research. 63, 18, S. 1-10 1900336.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Open Access

Retinoic acid determines the allergenicity of the major birch pollen allergen Bet v 1 in vitro and in vivo

Hufnagl, K., Afify, S., Braun, N., Wagner, S., Wiederstein, M., Hofstetter, G., Pali-Schoell, I., Roth-Walter, F., Pacios, L. F. & Jensen-Jarolim, E., Aug 2019, in : Allergy: European Journal of Allergy and Clinical Immunology. 74, S. 335-336

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftMeeting-Abstract

The cell wall PAC (Pro-rich, Arabinogalactan proteins, conserved Cysteines) domain-proteins are conserved in the green lineage

Nguyen-Kim, H., San Clemente, H., Kolkas, H., Laimer, J., Lackner, P., Gadermaier, G., Dunand, C. & Jamet, E., 2019.

Publikation: KonferenzbeitragAbstract

2018

Dissecting the subcellular membrane proteome reveals enrichment of H+ (co-)transporters and vesicle trafficking proteins in acidic zones of Chara internodal cells

Titel in Übersetzung: Dissecting the subcellular membrane proteome reveals enrichment of H+ (co-)transporters and vesicle trafficking proteins in acidic zones of Chara internodal cellsPertl-Obermeyer H, L. P., Foissner I, M. & Lackner, P., 2018, in : PLOS one.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Synergistic cross-talk of hedgehog and interleukin-6 signaling drives growth of basal cell carcinoma

Titel in Übersetzung: Synergistic Cross-Talk of Hedgehog and Interleukin-6 Signaling Drives Growth of Basal Cell CarcinomaSternberg, C., Gruber, W., Eberl, M., Tesanovic, S., Stadler, M., Elmer, D. P., Schlederer, M., Grund, S., Roos, S., Wolff, F., Kaur, S., Mangelberger, D., Lehrach, H., Hache, H., Wierling, C., Laimer, J., Lackner, P., Wiederstein, M., Kasper, M., Risch, A. &4 mehr, Petzelbauer, P., Moriggl, R., Kenner, L. & Aberger, F., 1 Dez 2018, in : International Journal of Cancer. 143, 11, S. 2943-2954

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

The pollen plasma membrane permeome converts transmembrane ion transport into speed

Titel in Übersetzung: The pollen plasma membrane permeome converts transmembrane ion transport into speedPertl-Obermeyer, H., Lackner, P., Dunlop, J. & Obermeyer, G., 2018, in : ADVANCES IN BOTANICAL RESEARCH.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2017

Allergens of Blomia tropicalis: An Overview of Recombinant Molecules

Titel in Übersetzung: Allergens of Blomia tropicalis: An Overview of Recombinant MoleculesSantos Da Silva, E., Asam, C., Lackner, P., Hofer, H., Wallner, M., Silva Pinheiro, C., Alcântara-Neves, N. M. & Ferreira, F., 2017, in : International Archives of Allergy and Immunology. 172, 4, S. 203-214

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftReview article

Characterization of a Phl p 6 mutant with increased structural stability

Soh, W. T., Stubenvoll, S., Brückl, A., Scheiblhofer, S., Laimer, J., Lackner, P., Thalhamer, J., Brandstetter, H. & Weiss, R., 17 Jun 2017.

Publikation: KonferenzbeitragPoster

Identification of proteases and protease inhibitors in allergenic and non-allergenic pollen

Titel in Übersetzung: Identification of proteases and protease inhibitors in allergenic and non-allergenic pollenHöllbacher, B., Schmitt, A. O., Hofer, H., Ferreira, F. & Lackner, P., 2017, in : International Journal of Molecular Sciences. 18, 6, 1199.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Influence of protein fold stability on immunogenicity and its implications for vaccine design

Titel in Übersetzung: Influence of protein fold stability on immunogenicity and its implications for vaccine designScheiblhofer, S., Laimer, J., Hernandez, Y. J. M., Weiss, R. & Thalhamer, J., 2017, in : Expert Review of Vaccines.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Influence of protein fold stability on immunogenicity and its implications for vaccine design

Titel in Übersetzung: Influence of protein fold stability on immunogenicity and its implications for vaccine designScheiblhofer, S., Laimer, J., Machado, Y., Weiss, R. & Thalhamer, J., 2017, in : Expert Review of Vaccines. 16, 5, S. 479-489

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftReview article

Multi-approach analysis for the identification of proteases within birch pollen

Titel in Übersetzung: Multi-approach analysis for the identification of proteases within birch pollenMcKenna, O. E., Posselt, G. B., Briza, P., Lackner, P., Schmitt, A. O., Gadermaier, G., Weßler, S. & Ferreira, F., 2017, in : International Journal of Molecular Sciences. 18, 7, 1433.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Tackling Bet v 1 and associated food allergies with a single hybrid protein

Titel in Übersetzung: Tackling Bet v 1 and associated food allergies with a single hybrid proteinHofer, H., Asam, C., Hauser, M., Nagl, B., Laimer, J., Himly, M., Briza, P., Ebner, C., Lang, R., Hawranek, T., Bohle, B., Lackner, P., Ferreira, F. & Wallner, M., 2017, in : Journal of Allergy and Clinical Immunology. 140, 2, S. 525-533

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2016

Fold stability during endolysosomal acidification is a key factor for allergenicity and immunogenicity of the major birch pollen allergen

Titel in Übersetzung: Fold stability during endolysosomal acidification is a key factor for allergenicity and immunogenicity of the major birch pollen allergenMachado, Y., Freier, R., Scheiblhofer, S., Thalhamer, T., Mayr, M., Briza, P., Grutsch, S., Ahammer, L., Fuchs, J. E., Wallnoefer, H. G., Isakovic, A., Kohlbauer, V., Hinterholzer, A., Steiner, M., Danzer, M., Horejs-Höck, J., Ferreira, F., Liedl, K. R., Tollinger, M., Lackner, P. &4 mehr, Johnson, C. M., Brandstetter, J., Thalhamer, J. & Weiss, R., Mai 2016, in : Journal of Allergy and Clinical Immunology. 137, 5, S. 1525-1534 10 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Open Access

MAESTROweb: a web server for structure based protein stability prediction: a web server for structure-based protein stability prediction

Titel in Übersetzung: MAESTROweb: a web server for structure based protein stability predictionLaimer, J., Hiebl-Flach, J., Lengauer, D. & Lackner, P., 1 Mai 2016, in : Bioinformatics. 32, 9, S. 1414-6 3 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Open Access

Nanoparticle-allergen interactions mediate human allergic responses: Protein corona characterization and cellular responses: protein corona characterization and cellular responses

Titel in Übersetzung: Nanoparticle-allergen interactions mediate human allergic responses: Protein corona characterization and cellular responsesRadauer-Preiml, I., Andosch, A., Hawranek, T., Lütz-Meindl, U., Wiederstein, M., Horejs-Höck, J., Himly, M., Boyles, M. & Duschl, A., 16 Jan 2016, in : Particle and Fibre Toxicology. 13, 1, S. 1-15 3.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Open Access

The Hyper-Allergenic Isoform Bet v 1a of the Major Birch Pollen Allergen Displays Reduced Allergenic Potential after Binding of Retinoic Acid

Titel in Übersetzung: The Hyper-Allergenic Isoform Bet v 1a of the Major Birch Pollen Allergen Displays Reduced Allergenic Potential after Binding of Retinoic AcidHufnagl, K., Wagner, S., F.Pacios, L., Wallner, M., Wiederstein, M., Hofstetter, G., Roth-Walter, F. & Jensen-Jarolim, E., 2016.

Publikation: KonferenzbeitragPoster

2015

MAESTRO - multi agent stability prediction upon point mutations

Titel in Übersetzung: MAESTRO - multi agent stability prediction upon point mutationsLaimer, J., Hofer, H., Fritz, M., Wegenkittl, S. & Lackner, P., 16 Apr 2015, in : BMC Bioinformatics. 16, S. 1-13 13 S., 116.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Open Access

Nanoparticle-allergen interactions mediate human allergic responses: protein corona characterization and cellular responses

Titel in Übersetzung: Nanoparticle-allergen interactions mediate human allergic responses: protein corona characterization and cellular responsesRadauer-Preiml, I., Andosch, A., Hawranek, T., Luetz-Meindl, U., Wiederstein, M., Horejs-Hoeck, J., Himly, M., Boyles, M. S. P. & Duschl, A., 2015, in : Particle and Fibre Toxicology.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2014

Differences in the intrinsic immunogenicity and allergenicity of Bet v 1 and related food allergens revealed by site-directed mutagenesis

Titel in Übersetzung: Differences in the intrinsic immunogenicity and allergenicity of Bet v 1 and related food allergens revealed by site-directed mutagenesisRoulias, A., Pichler, U., Hauser, M., Himly, M., Hofer, H., Lackner, P., Ebner, C., Briza, P., Bohle, B., Egger, M., Wallner, M. & Ferreira, F., 2014, in : ALLERGY. S. 208-15

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Immunological characterization of a Pru p 3 proline variant for treatment of LTP-related peach allergy

Gadermaier, G., Laimer, J., Ocampo, I. M. P., Eichhorn, S. P. & Ferreira, F., 2014.

Publikation: KonferenzbeitragAbstract

Pru p 3 mimicks

Gadermaier, G., Wallner, M., Lackner, P. & Ferreira, F., 17 Dez 2014, Patent Nr. 2813243, 14 Aug 2013, Prioritätsnr. 13171445.3 - 1412

Publikation: PatentPatentschrift

Structure-Based Characterization of Multiprotein Complexes

Titel in Übersetzung: Structure-Based Characterization of Multiprotein ComplexesWiederstein, M., Gruber, M., Frank, K., Melo, F. & Sippl, M. J., 8 Jul 2014, in : Structure. 22, 7, S. 1063-1070 8 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2013

Automated clustering of protein structures and complexes

J.Sippl, M., Frank, K., Gruber, M. & Wiederstein, M., 2013.

Publikation: KonferenzbeitragPoster

Comprehensive analysis of alterations in the miRNome in response to photodynamic treatment

Titel in Übersetzung: Comprehensive analysis of alterations in the miRNome in response to photodynamic treatmentBach, D., Fuereder, J., Karbiener, M., Scheideler, M., Lena, R. A., Neureiter, D., Kemmerling, R., Dietze, O., Wiederstein, M., Berr, F., Plätzer, K., Kiesslich, T. & Pichler, M., 5 Mär 2013, in : Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology. 120, S. 74-81 8 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Development of a hypoallergenic and immunogenic Pru p 3 proline variant for treatment of peach allergy

Eichhorn, S. P., Steiner, M., Laimer, J., Lackner, P., Zuidmeer-Jongejan, L., Briza, P., Mari, A., Ree, R. V., Ferreira, F. & Gadermaier, G., 2013.

Publikation: KonferenzbeitragAbstract

D-Light on promoters: a client-server system for the analysis and visualization of cis-regulatory elements

Titel in Übersetzung: D-Light on promoters: a client-server system for the analysis and visualization of cis-regulatory elementsLaimer, J., Zuzan, C. J., Ehrenberger, T., Freudenberger, M., Gschwandtner, S., Lebherz, C. & Lackner, P., 24 Apr 2013, in : BMC Bioinformatics. 14, S. 1-8 140.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Open Access

Structural and functional collection of biological units

J.Sippl, M., Frank, K., Wiederstein, M. & Gruber, M., 2013.

Publikation: KonferenzbeitragPoster

2012

Detection of spatial correlations in protein structures and molecular complexes

Titel in Übersetzung: Detection of Spatial Correlations in Protein Structures and Molecular ComplexesSippl, M. J. & Wiederstein, M., 4 Apr 2012, in : Structure. 20, 4, S. 718-728 11 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Effective techniques for protein structure mining

Suhrer, S. J., Gruber, M., Wiederstein, M. & Sippl, M. J., 2012, in : Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 857, S. 33-54 22 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Nitration of the pollen allergen bet v 1.0101 enhances the presentation of bet v 1-derived peptides by HLA-DR on human dendritic cells

Titel in Übersetzung: Nitration of the pollen allergen bet v 1.0101 enhances the presentation of bet v 1-derived peptides by HLA-DR on human dendritic cellsKarle, AC., Oostingh, GJ., Mutschlechner, S., Ferreira, F., Lackner, P., Bohle, B., Fischer, GF., Vogt, AB. & Duschl, A., 2012, in : PLOS one.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2011

Leben nach Plan - Utopien in den Biowissenschaften

Wiederstein, M., 2011, Europäische Projektkultur als Beitrag zur Rationalisierung des Rechts. ÖCG, S. 613-618 (Tagungsband des Internationalen Rechtsinformatik Symposions IRIS).

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandKonferenzbeitrag

2010

Designing hypoallergenic derivatives for allergy treatment by means of in silico mutation and screening

Titel in Übersetzung: Designing hypoallergenic derivatives for allergy treatment by means of in silico mutation and screeningThalhamer, T., Dobias, H., Stepanoska, T., Pröll, M., Stutz, E-H., Dissertori, O., Lackner, P., Ferreira, F., Wallner, M., Thalhamer, J. & Hartl, A. J., 2010, in : Journal of Allergy and Clinical Immunology. S. 926-934

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2009

Accuracy analysis of multiple structure alignments

Titel in Übersetzung: Accuracy analysis of multiple structure alignmentsBerbalk, C., Schwaiger, CS. & Lackner, P., 2009, in : Protein Science. S. 2027-35

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

COPS--a novel workbench for explorations in fold space

Suhrer, S. J., Wiederstein, M., Gruber, M. & Sippl, M. J., Jul 2009, in : Nucleic Acids Research. 37, Web Server issue, S. W539-44

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

COPS—a novel workbench for explorations in fold space

Titel in Übersetzung: COPS—a novel workbench for explorations in fold spaceSuhrer, S., Wiederstein, M., Gruber, M. & Sippl, M. J., 2009, in : Nucleic Acids Research. S. W539-W544

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Identification of B-cell epitopes of Bet v 1 involved in cross-reactivity with food allergens

Titel in Übersetzung: Identification of B-cell epitopes of Bet v 1 involved in cross-reactivity with food allergensKlinglmayr, E., Hauser, M., Zimmermann, F., Dissertori, O., Lackner, P., Wopfner, N., Ferreira, F. & Wallner, M., 2009, in : ALLERGY. S. 647-651

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Structural diversity of calcium binding sites

Titel in Übersetzung: Structural diversity of calcium binding sitesBindreither, D. & Lackner, P., 2009, in : General physiology and biophysics. S. F82-F88

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

The vacuolar serine protease, a cross-reactive allergen from cladiosporum herbarum

Titel in Übersetzung: The vacuolar serine protease, a cross-reactive allergen from cladiosporum herbarumPöll, V., Denk, U., Shen, HD., Panzani, RC., Dissertori, O., Lackner, P., Hemmer, W., Mari, A., Crameri, R., Lottspeich, F., Rid, R., Richter, K., Breitenbach, M. & Simon-Nobbe, B., 2009, in : Molecular immunology.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

The vacuolar serine protease, a cross-reactive allergen from Cladosporium herbarum

Titel in Übersetzung: The vacuolar serine protease, a cross-reactive allergen from Cladosporium herbarumPöll, V., Denk, U., Shen, H-D., C.Panzani, R., Dissertori, O., Lackner, P., Hemmer, W., Mari, A., Crameri, R., Lottspeich, F., Rid, R., Richter, K., Breitenbach, M. & Simon-Nobbe, B., 2009, in : Molecular immunology. S. 1360-1373 14 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2008

A Discrete View on Fold Space

Titel in Übersetzung: A Discrete View on Fold SpaceSippl, M. J., Suhrer, S. J., Gruber, M., Wiederstein, M. & Suhrer, S., 15 Mär 2008, in : Bioinformatics. 24, 6, S. 870-871 2 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

A note on difficult structure alignment problems

Titel in Übersetzung: A Note on Difficult Structure Alignment ProblemsSippl, M. J. & Wiederstein, M., 1 Feb 2008, in : Bioinformatics. 24, 3, S. 426-7 2 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Automated Quantitative Assessment of Proteins' Biological Function in Protein Knowledge Bases

Titel in Übersetzung: Automated Quantitative Assessment of Proteins' Biological Function in Protein Knowledge BasesMayr, G., Lepperdinger, G. & Lackner, P., 2008, in : Advances in Bioinformatics. 2008, 7 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Generation of a hypoallergenic Bet v 1 derivative by epitope grafting

Titel in Übersetzung: Generation of a hypoallergenic Bet v 1 derivative by epitope graftingHauser, M., Wallner, M., Klinglmayr, E., Gadermaier, G., Wopfner, N., Vogel, L., Lackner, P., Bohle, B. & Ferreira, F., 2008.

Publikation: KonferenzbeitragAbstract

The Bet v 1 fold: an ancient, versatile scaffold for binding of large, hydrophobic ligands

Titel in Übersetzung: The Bet v 1 fold: an ancient, versatile scaffold for binding of large, hydrophobic ligandsRadauer, C., Lackner, P. & Breiteneder, H., 2008, in : BMC Evolutionary Biology. 19 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2007

Allergy multi-vaccines created by DNA shuffling of tree pollen allergens

Titel in Übersetzung: Allergy multi-vaccines created by DNA shuffling of tree pollen allergensWallner, M., Stöcklinger, A., Thalhamer, T., Bohle, B., Vogel, L., Ferreira, F., Breiteneder, H., Vieths, S., Hartl, A., Mari, A., Ebner, C., Lackner, P., Hammerl, P., Thalhamer, J. & Ferreira, F., 2007, in : Journal of Allergy and Clinical Immunology. S. 374-380

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Calcium-binding proteins and their role in allergic diseases

Titel in Übersetzung: Calcium-binding proteins and their role in allergic diseasesWopfner, N., Dissertori, O., Ferreira, F. & Lackner, P., 2007, in : Immunol Allergy Clin North Am. S. 117-20

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftReview article

Calcium-binding proteins and their role in allergic diseases

Titel in Übersetzung: Calcium-binding proteins and their role in allergic diseasesWopfner, N., Dissertori, O., Ferreira, F. & Lackner, P., 2007, in : Immunol Allergy Clin North Am. S. 29-44

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftReview article

Comparative analysis of protein structure alignments

Titel in Übersetzung: Comparative analysis of protein structure alignmentsMayr, G., Domingues, FS. & Lackner, P., 2007, in : BMC STRUCTURAL BIOLOGY.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

ProSA-web: interactive web service for the recognition of errors in three-dimensional structures of proteins

Titel in Übersetzung: ProSA-web: interactive web service for the recognition of errors in three-dimensional structures of proteinsWiederstein, M. & Sippl, M. J., 2007, in : Nucleic Acids Research. S. W407-W410

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

QSCOP - SCOP quantified by structural relationships

Titel in Übersetzung: QSCOP - SCOP quantified by structural relationshipsSuhrer, S. J., Wiederstein, M. & Sippl, M. J., 15 Feb 2007, in : Bioinformatics. 23, 4, S. 513-514 2 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2005

Pathogenic mutations inactivate parkin by distinct mechanisms

Titel in Übersetzung: Pathogenic mutations inactivate parkin by distinct mechanismsHenn, IH., Gostner, JM., Lackner, P., Tatzelt, J. & Winklhofer, KF., 2005, in : Journal of Neurochemistry. S. 114-122

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Protein sequence randomization: efficient estimation of protein stability using knowledge-based potentials

Titel in Übersetzung: Protein Sequence Randomization: Efficient Estimation of Protein Stability Using Knowledge-Based PotentialsWiederstein, M. & Sippl, M. J., 4 Feb 2005, in : Journal of Molecular Biology. 345, 5, S. 1199-1212 13 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2004

Directed in silico Mutagenesis

Titel in Übersetzung: Directed in silico MutagenesisWiederstein, M., Lackner, P., Kienberger, F. & Sippl, M. J., 2004, Evolutionary Methods in Biotechnology. Wiley-VCH, S. 153-175 23 S.

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/KonferenzbandKapitel in einem Sammelband

WILMA-automated annotation of protein sequences

Titel in Übersetzung: WILMA-automated annotation of protein sequencesPrlic, A., Domingues, FS., Lackner, P. & Sippl, MJ., 2004, in : Bioinformatics. S. 127-128

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2003

ProMine: Identification of Protein Family Members Using Profiles Derived From Multiple Structure Alignments

Titel in Übersetzung: ProMine: Identification of Protein Family Members Using Profiles Derived From Multiple Structure AlignmentsPrlic, A., Lackner, P. & Sippl, M. J., 2003, 1 S.

Publikation: Andere BeiträgeSonstiger BeitragForschungPeer-reviewed

ProSupSpace - a Webservice to Search the SCOP Classification for Similar Structures

Titel in Übersetzung: ProSupSpace - a Webservice to Search the SCOP Classification for Similar StructuresSuhrer, S., Prlic, A., Leong, J., Sippl, M. J. & Lackner, P., 2003, 1 S.

Publikation: Andere BeiträgeSonstiger BeitragForschungPeer-reviewed

2002

Gene Expression Profiling of Cold Ischemia/Reperfusion (I/R) Injury in Murine Cardiac Isografts

Titel in Übersetzung: Gene Expression Profiling of Cold Ischemia/Reperfusion (I/R) Injury in Murine Cardiac IsograftsSchneeberger, S., Mark, W., Brandacher, G., Obrist, P., Lackner, P., Hernegger, G., Meusburger, H., Renz, O., Margreiter, R. & Amberger, A., 2002. 1 S.

Publikation: KonferenzbeitragAbstract

Gene expression profiling of prolonged cold ischemia and reperfusion in murine heart transplants

Titel in Übersetzung: Gene expression profiling of prolonged cold ischemia and reperfusion in murine heart transplantsAmberger, A., Schneeberger, S., Hernegger, G., Brandacher, G., Obrist, P., Lackner, P., Margreiter, R. & Mark, W., 2002, in : Transplantation. 74, 10, S. 1441-1449 9 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

2001

Assessment of the CASP4 Fold Recognition Category

Titel in Übersetzung: Assessment of the CASP4 Fold Recognition CategorySippl, M. J., Lackner, P., Domingues, F. S., Prlic, A., Malik, R., Andreeva, A. & Wiederstein, M., 2001, in : Proteins: Structure, Function and Genetics. S. 55-67 13 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Wilma, a platform for the annotation of C.elegans proteins

Titel in Übersetzung: Wilma, a platform for the annotation of C.elegans proteinsPrlic, A., Domingues, F. S., Lackner, P. & Sippl, M. J., 2001. 1 S.

Publikation: KonferenzbeitragAbstract

2000

Characterization of novel proteins based on known protein structures

Titel in Übersetzung: Characterization of novel proteins based on known protein structuresKoppensteiner, W. A., Lackner, P., Wiederstein, M. & Sippl, M. J., 3 Mär 2000, in : Journal of Molecular Biology. 296, 4, S. 1139-1152 14 S.

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

Evaluation of Structural Models of Proteins Using Neural Networks

Titel in Übersetzung: Evaluation of Structural Models of Proteins Using Neural NetworksBenhabilès, N., Lackner, P., Domingues, F. S., Wegenkittl, S. & Sippl, M. J., 2000.

Publikation: KonferenzbeitragAbstract

Evaluation of Structural Models of Proteins Using Neural Networks

Titel in Übersetzung: Evaluation of Structural Models of Proteins Using Neural NetworksBenhabilès, N., Lackner, P., Domingues, F. S., Wegenkittl, S. & Sippl, M. J., 2000.

Publikation: KonferenzbeitragAbstract

1999

Automated Large Scale Evaluation of Protein Structure Predictions

Titel in Übersetzung: Automated Large Scale Evaluation of Protein Structure PredictionsLackner, P., Koppensteiner, W. A., Domingues, F. S. & Sippl, M. J., 1999, in : Proteins: Structure, Function and Genetics. 37, 53, S. 7-14

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

CASP3 prediction results for the fold recognition tool ProFIT

Titel in Übersetzung: CASP3 prediction results for the fold recognition tool ProFITWiederstein, M., Domingues, F. S., Koppensteiner, W. A., Jaritz, M., Prlic, A., Weichenberger, C., Flöckner, H., Lackner, P. & Sippl, M. J., 1999.

Publikation: KonferenzbeitragPoster

Strategy for an Automated Evaluation of Protein Structure Predictions

Titel in Übersetzung: Strategy for an Automated Evaluation of Protein Structure PredictionsLackner, P., Koppensteiner, W. A., Domingues, F. S. & Sippl, M. J., 1999.

Publikation: KonferenzbeitragAbstract

Sustained Performance of Knowledge-Based Potentials in Fold Recognition

Titel in Übersetzung: Sustained Performance of Knowledge-Based Potentials in Fold RecognitionDomingues, F. S., Koppensteiner, W. A., Jaritz, M., Prlic, A., Weichenberger, C., Wiederstein, M., Flöckner, H., Lackner, P. & Sippl, M. J., 1999, in : Proteins: Structure, Function and Genetics. S. 112-120

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikel

The coverage of protein fold recognition

Titel in Übersetzung: The coverage of protein fold recognitionKoppensteiner, W. A., Wiederstein, M., Lackner, P. & Sippl, M. J., 1999.

Publikation: KonferenzbeitragPoster